| 日本淡水産紅藻リスト（仮）和名索引 ア行 | |
| ア | |
| アオカワモズク Virescentia helminthosa auct. non (Bory) Necchi, Agostinho & M.L. Vis (2018) | 紅藻植物門 真正紅藻亜門 真正紅藻綱 ウミゾウメン亜綱 カワモズク目 カワモズク科 アオカワモズク属 |
| アオカワモズク属 Virescentia | 紅藻植物門 真正紅藻亜門 真正紅藻綱 ウミゾウメン亜綱 カワモズク目 カワモズク科 |
| アカカワモズク Batrachospermum rubescens | カワモズク（Batrachospermum gelatinosum）の異名 |
| アクロカエティウム目 Acrochaetiales | 紅藻植物門 真正紅藻亜門 真正紅藻綱 ウミゾウメン亜綱 |
| アクロカエティウム科 Acrochaetiaceae | 紅藻植物門 真正紅藻亜門 真正紅藻綱 ウミゾウメン亜綱 アクロカエティウム目 |
| アズキイロカワモズク Batrachospermum sporiferum | 紅藻植物門 真正紅藻亜門 真正紅藻綱 ウミゾウメン亜綱 カワモズク目 カワモズク科 カワモズク属 |
| アツカワオオイシソウ Compsopogon corticrassus | オオイシソウ（Compsopogon caeruleus）の異名。 |
| アヤギヌ属 Caloglossa | 紅藻植物門 真正紅藻亜門 真正紅藻綱 マサゴシバリ亜綱 イギス目 コノハノリ科 サルコメニア亜科 アヤギヌ連 |
| アヤギヌ連 Caloglosseae | 紅藻植物門 真正紅藻亜門 真正紅藻綱 マサゴシバリ亜綱 イギス目 コノハノリ科 サルコメニア亜科 |
| イ | |
| イギス目 Ceramiales | 紅藻植物門 真正紅藻亜門 真正紅藻綱 マサゴシバリ亜綱 |
| イシカワモズク Torularia atra (Hudson) M.J. Wynne | 紅藻植物門 真正紅藻亜門 真正紅藻綱 ウミゾウメン亜綱 カワモズク目 カワモズク科 イシカワモズク属 |
| イシカワモズク属 Torularia (Hudson) M.J. Wynne | 紅藻植物門 真正紅藻亜門 真正紅藻綱 ウミゾウメン亜綱 カワモズク目 カワモズク科 |
| イバラオオイシソウ Compsopogon aeruginosus | オオイシソウ（Compsopogon caeruleus）の異名。 |
| イリオモテカワモズク Kumanoa iriomotensis | 紅藻植物門 真正紅藻亜門 真正紅藻綱 ウミゾウメン亜綱 カワモズク目 カワモズク科 クマノカワモズク属 |
| インドオオイシソウ Compsopogon hookeri | オオイシソウ（Compsopogon caeruleus）の異名。 |
| ウ | |
| ウシケノリ科 Bangiaceae | 紅藻植物門 真正紅藻亜門 ウシケノリ綱 ウシケノリ目 |
| ウシケノリ綱 Bangiophyceae | 紅藻植物門 真正紅藻亜門 |
| ウシケノリ属 Bangia | 紅藻植物門 真正紅藻亜門 ウシケノリ綱 ウシケノリ目 ウシケノリ科 |
| ウシケノリ目 Bangiales | 紅藻植物門 真正紅藻亜門 ウシケノリ綱 |
| ウミゾウメン亜綱 Nemaliophycidae | 紅藻植物門 真正紅藻亜門 真正紅藻綱 |
| エ | |
| オ | |
| オオイシソウ Compsopogon caeruleus | 紅藻植物門 原始紅藻亜門 オオイシソウ綱 オオイシソウ目 オオイシソウ科 オオイシソウ属 |
| オオイシソウ科 Compsopogonaceae | 紅藻植物門 原始紅藻亜門 オオイシソウ綱 オオイシソウ目 |
| オオイシソウ綱 Compsopogonophyceae | 紅藻植物門 原始紅藻亜門 |
| オオイシソウ属 Compsopogon | 紅藻植物門 原始紅藻亜門 オオイシソウ綱 オオイシソウ目 オオイシソウ科 |
| オオイシソウ目 Compsopogonales | 紅藻植物門 原始紅藻亜門 オオイシソウ綱 |
| オオイシソウモドキ Compsopogonopsis japonica | オオイシソウ（Compsopogon caeruleus）の異名。 |
| オオイシソウモドキ属 Compsopogonopsis | 日本産種はオオイシソウ（Compsopogon caeruleus）の異名となり，オオイシソウモドキ属は用いられなくなった。 |
| オキチモズク Nemalionopsis shawii | 紅藻植物門 真正紅藻亜門 真正紅藻綱 チスジノリ目 チスジノリ科 オキチモズク属 |
| オキチモズク属 Nemalionopsis | 紅藻植物門 真正紅藻亜門 真正紅藻綱 チスジノリ目 チスジノリ科 |
| オージュイネラ属 Genus Audouinella | 紅藻植物門 真正紅藻亜門 真正紅藻綱 ウミゾウメン亜綱 アクロカエティウム目 アクロカエティウム科 |
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