ケルコゾアの分類体系(改訂版)
 
執筆:大田 修平 作成日:2010年10月6日 改訂日:2011年2月24日
 
 このリストは,ケルコゾア門の科レベルまでの分類系を示したものです。このリストは,個人が運営しているウエブサイトでの見解であり,正式なものではありません。この分類体系の著者名に関するレファレンス・リストは現在作成中です。
 
System of Cercozoa, updated on 24 February 2011
Note: This list is addressed as a current classification system of Cercozoa above family-rank. This is a private website written by Shuhei Ota without peer reviews. It was taken care of details but there would be some mistakes.
 
更新情報

2011年2月24日

Howe et al. (2011) に基づき,以下のように分類体系,名称を更新しました。
(1) モナドフィローサのランクを上綱から下門に変更しました。
(2)エブリア目をテコフィローサ綱に移し,ファエオダリア亜綱,クリオモナス目(リザスピス科,プロタスパ科),ヴェントリクレフト目を追加しました。
(3) スポンゴモナス目をインブリカテア綱に移しました。
(4) ペレグリニア科をタウマトモナス目に追加しました。
(5)マリモナス目をインブリカテア綱に加えました。
(6) トレムラ目をフィローサ亜門の所属不明として加えました。
(7) ヌディフィラ科をインブリカテア綱の所属不明として加えました。。
(8) ユーグリファ目にオヴリナタ科を加えました。
(9) サルコモナス綱にパンソモナス目,アギタタ科,グリソモナス目,サンドナ科,アラプシド科,ボドモルファ科,プロレプトモナス科を加えました。

(10) メトピオン目をメトロモナス綱に移しました。
 
略語の説明
emend. = 分類群の判別文が変更された。
orthog. emend. (orth. mut.) = 綴りが変更された。
n.v. (non vidi) = 著者は原典を見ていません。
 
クロミスタ界
Kingdom Chromista Cavalier-Smith, 1981 emend. Cavalier-Smith 2010
Note: ここでは Cavalier-Smith (2010) に従い,リザリアをクロミスタ界に置きました。
   
ハロサ亜界
Subkingdom Harosa Cavalier-Smith, 2010
Note: ハロサ亜界はBurki et al. (2007) の SAR クレードに相当します。
 
リザリア下界
Infrakingdom Rhizaria Cavalier-Smith, 2002 emend. Cavalier-Smith 2010
 
ケルコゾア門(アメーバ鞭毛虫門)
Phylum Cercozoa Cavalier-Smith, 1998
 
フィローサ亜門 Subphylum Filosa Cavalier-Smith, 2003
 
    レティキュロフィローサ上綱 Superclass Reticulofilosa Cavalier-Smith, 1997
 
      クロララクニオン綱 Class Chlorarachnea Cavalier-Smith, 1998 (= Chlorarachniophyceae Hibberd & Norris, 1984)
      Note: 括弧内は 国際植物命名規約(ICBN)における表記です。
     
        クロララクニオン目 Order Chlorarachniida Hibberd & Norris, 1984 (= Chlorarachniales Ishida & Y. Hara 1996)
        Note: 括弧内は 国際植物命名規約(ICBN)における表記です。
 
          クロララクニオン科 Family Chlorarachniidae Hibberd & Norris, 1984 (=Chlorarachniaceae Ishida & Y. Hara 1996)
          Note: 括弧内は 国際植物命名規約(ICBN)における表記です。植物命名規約では科のレベルの名前は優先権を持ちます。Chlorarachniaceaeという科の学名はIshida & Y. Hara 1996より先にPascherが発表しているため,Chlorarachniaceae Pascher 1939となる可能性がありますが,この学名が有効かどうか精査中ですので,暫定的にIshida & Y. Hara 1996としました。
         
      グラノフィロセア綱 Class Granofilosa Cavalier-Smith & Bass, 2009
 
        ロイコディクティオン目 Order Leucodictyida Cavalier-Smith, 1993 emend. Cavalier-Smith, 2003
 
          ロイコディクティオン科 Family Leucodictyidae Cavalier-Smith, 1993
           
          マシステリア科 Family Massisteriidae Cavalier-Smith, 1993
 
        リムノフィラ目 Order Limnofilida Cavalier-Smith & Bass, 2009
 
          リムノフィラ科 Family Limnofilidae Cavalier-Smith & Bass, 2009
 
        クリプトフィリダ目 Order Cryptofilida Cavalier-Smith & Bass, 2009
 
          ナノフィラ科 Family Nanofilidae Cavalier-Smith & Bass, 2009
           
          メソフィラ科 Family Mesofilidae Cavalier-Smith & Bass, 2009
 
        有殻太陽虫目 Order Desmothoracida Hertwig & Lesser, 1874
               
          カルチュリナ科 Family Clathrulinidae Claus, 1874
               
        ヘリオモルファ目 Order Heliomonadida Cavalier-Smith, 1993
         
          ヘリオモルファ科 Family Heliomorphidae Cavalier-Smith & Bass, 2009
       
          アキネタクシス科 Family Acinetactidae Stokes, 1886
           
          テトラディモルファ科 Tetradimorphidae Febvre-Chevalier & Febvre, 1984
         
  モナドフィローサ下門 Infraphylum Monadofilosa Cavalier-Smith, 1997
             
      インブリカテア綱 Class Imbricatea Cavalier-Smith, 2003
             
        タウマトモナス目 Order Thaumatomonadida Shirkina, 1987
               
          タウマトモナス科 Family Thaumatomonadidae Hollande,1952
         

Note: Thaumatomastigidae Patterson & Zölffel, 1991は,ICBN下で正式に発表されておらず,また,ICZN下で不適格な学名のため,タウマトマスティギア科をタウマトモナス科 Thaumatomonadidae に変更しました。

               
          ペレグリニア科 Family Peregriniidae Cavalier-Smith, 2011
               
        ユーグリファ目 Order Euglyphida Copeland 1956 emend. Cavalier-Smith, 1997
               
          サイフォデリア科 Family Cyphoderiidae de Saedeleer, 1934
                 
          ユーグリファ科 Family Euglyphidae Wallich, 1864 emend. Lara et al. 2007
          Note: Lara et al. (2007)では,「Euglyphidae Wallich, 1864 emend. Lara et al., 2006」と書いてありますが,「Euglyphidae Wallich, 1864 emend. Lara et al., 2007」が正しいと思われます。
                 
          オヴリナタ科 Family Ovulinatidae Cavalier-Smith, 2011
           
          ポーリネラ科 Family Paulinellidae de Saedeller, 1934
               
          トリネマ科 Family Trinematidae Hoogenraad & de Groot, 1940
                   
        スポンゴモナス目 Order Spongomonadida Hibberd, 1983
       
          スポンゴモナス科 Family Spongomonadidae Karpov, 1990
         
        マリモナス目 Order Marimonadida Cavalier-Smith & Bass, 2011
 
      メトロモナス綱 Class Metromonadea, n. v.
               
        メトロモナス目 Metromonadida Bass & Cavalier-Smith, 2004
               
          メトロモナス科 Family Metromonadidae Bass & Cavalier-Smith, 2004
               
        メトピオン目 Order Metopiida Cavalier-Smith, 2003
       
          メトピオン科 Family Metopiidae Cavalier-Smith, 2003
               
      サルコモナス綱 Class Sarcomonadea Cavalier-Smith, 1993 emend. Cavalier-Smith, 2011
       
        ケルコモナス目 Order Cercomonadida Poche, 1913 emend. Vickerman in Honigberg, 1983
               
          ケルコモナス科 Family Cercomonadidae Kent, 1880 emend. Cavalier-Smith, 1993
                 
          ヘテロミータ科 Family Heteromitidae Kent 1880, emend. Mylnikov 1990, emend. Mylnikov & Karpov 2004
               
        パンソモナス目 Order Pansomonadida Vickerman, 2005
         
          アギタタ科 Family Agitatidae Cavalier-Smith & Bass, 2009
           
        グリソモナス目 OrderGlissomonadida Howe et al. 2009
           
          サンドナ科 Family Sandonidae Howe et al. 2009
             
          アラプシド科 Family Allapsidae Howe et al. 2009
             
          ボドモルファ科 Family Bodomorphidae Hollande, 1952
             
          プロレプトモナス科 Family Proleptomonadidae Howe et al. 2009
             
      テコフィローサ綱 Class Thecofilosa Cavalier-Smith, 2003
             
          テクトフィロシダ目 Order Tectofilosida Cavalier-Smith, 2003
             
            シュードディフルギア科 Family Pseudodifflugiidae de Saedeleer, 1934
             
            クラミドフリス科 Family Chlamydophryidae de Saedeleer, 1934
             
            プサモノビオータス科 Family Psammonobiotidae Golemansky, 1974
             
            アンフィトレマ科 Family Amphitremidae Poche, 1913
             
            ヴォルテラ科 Family Volutellidae, n. v.
           
          エブリア目 Ebriida Ebriida Deflandre, 1936
                 
            エブリア科 Ebriidae Poche, 1913
                 
        ファエオダリア亜綱 Subclass Phaeodaria Haeckel, 1879
               
          クリオモナス目 Order Cryomonadida Cavalier-Smith, 2003, emend. Cavalier-Smith, 2011
               
            リザスピス科 Family Rhizaspididae Skuja, 1948, orthog. emend. Howe et al. 2011
               
            プロタスパ科 Family Protaspidae Cavalier-Smith, 1993
           
          ヴェントリクレフト目 Order Ventricleftida Cavalier-Smith, 2011
               
所属不明 Incertae Sedis within Imbricatea
             
            ヌディフィラ科 Family Nudifilidae Cavalier-Smith, 2011
 
所属不明 Incertae Sedis within Filosa
               
          トレムラ目 Tremulida Cavalier-Smith & Howe, 2011
               
エンドミクサ亜門 Subphylum Endomyxa Cavalier-Smith, 2002 emend. Cavalier-Smith & Bass 2009
         
      フィトミクサ綱 Class Phytomyxea Engler & Prantl, 1897 orthog. emend Cavalier-Smith, 1993
             
          ファゴミクサ目 Order Phagomyxida Cavalier-Smith, 1993
               
            ファゴミクサ科 Phagomyxidae Cavalier-Smith, 1993
               
          ネコブカビ目 Order Plasmodiophorida Cook, 1928
               
            ネコブカビ科 Plasmodiophoridae Zopf 1884 orthog. emend. Cavalier-Smith, 1993
               
      アセトスポレア綱 Class Ascetosporea Sprague, 1979; Cavalier-Smith, 2002
             
          ハプロスポリディウム目 Order Haplosporida Caullery & Mesnil, 1899
               
            ハプロスポリディニウム科 Family Haplosporidiidae Sprague, 1979
               
          パラミクサ目 Order Paramyxida Chatton, 1911
               
            パラミクサ科 Paramyxidae, n. v.
                  Note: 著者はパラミクサ科が発表された文献を把握していません。
               
          クラウストロスポリディウム目 Order Claustrosporida Cavalier-Smith, 2003
               
            クラウストロスポリディウム科 Claustrosporidae Cavalier-Smith, n. v.
               
          パラディニウム目 Order Paradinida Cavalier-Smith, 2009
               
            パラディニウム科 Paradiniidae Schiller, 1935
             
      グロミア綱 Class Gromiidea Cavalier-Smith, 2003
             
          グロミア目 Order Gromida Claparède & Lachmann, 1856
             
            グロミア科 Gromiidae Claparède & Lachmann, 1861
             
      プロテオミクシデア綱 Class Proteomyxidea Cavalier-Smith, 2002 emend. Cavalier-Smith & Bass, 2009
             
          レティキュロシダ目 Order Reticulosida Cavalier-Smith, 2003 emend. Cavalier-Smith & Bass, 2009
               
            フィロレータ科 Filoretidae Cavalier-Smith and Bass, 2009
               
          アコンクリニダ目 Order Aconchulinida De Saedeleer, 1934 emend. Cavalier-Smith & Bass, 2009
               
            ヴァンピレラ科 Vampyrellidae Zopf, 1885
                 
            ビオミクサ科 Biomyxidae Loeblich & Tappan, 1961
               
          シュードスポラ目 Order Pseudosporida Cavalier-Smith, 1993
 
            シュードスポラ科 Pseudosporidae Berlese in Saccardo, 1888
 
主なレファレンス
 
Bass, D., and Cavalier-Smith, T. 2004. Phylum-specific environmental DNA analysis reveals remarkably high global biodiversity of Cercozoa (Protozoa). International Journal of Systematic and Evolutionary Microbiology 54: 2393-2404.
 
Bass, D., Chao, E. E., Nikolaev, S., Yabuki, A., Ishida, K., Berney, C., Pakzad, U., Wylezich, C., and Cavalier-Smith, T. 2009. Phylogeny of novel naked Filose and Reticulose Cercozoa: Granofilosea cl. n. and Proteomyxidea revised. Protist 160: 75-109.
 
Burki, F., Shalchian-Tabrizi, K., Minge, M., Skjaeveland, A., Nikolaev, S.I., Jakobsen, K.S., and Pawlowski, J. 2007. Phylogenomics reshuffles the eukaryotic supergroups. PLoS One 2: e790.
 
Cavalier-Smith, T. 1993. Kingdom protozoa and its 18 phyla. Microbiological Reviews 54: 953-994.
 
Cavalier-Smith, T. 1993. The Protozoan Phylum Opalozoa. Journal of Eukaryotic Microbiology 40: 609-615.
 
Cavalier-Smith, T. 1998. A revised six-kingdom system of life. Biology Reviews 73: 203-266.
 
Cavalier-Smith, T. 2010. Kingdoms Protozoa and Chromista and the eozoan root of the eukaryotic tree. Biology Letters 6: 342-345.
 
Cavalier-Smith, T., and Chao, E. E. 2003. Phylogeny and classification of phylum Cercozoa (Protozoa). Protist 154: 341-358.
 
Howe, A. T., Bass, D., Scoble, J. M., Lewis, R., Vickerman, K., Arndt, H., et al. 2011. Novel cultured protists identify deep-branching environmental DNA clades of Cercozoa: new genera Tremula, Micrometopion, Minimassisteria, Nudifila, Peregrinia. Protist. doi: 10.1016/j.protis.2010.10.002.
 
Howe, A. T., Bass, D., Vickerman, K., Chao, E. E., & Cavalier-Smith, T. 2009. Phylogeny, taxonomy, and astounding genetic diversity of glissomonadida ord. nov., the dominant gliding zooflagellates in soil (Protozoa: Cercozoa). Protist 160: 159-89.
 
Hoppenrath, M., and Leander, B. S. 2006. Ebriid phylogeny and the expansion of the Cercozoa. Protist 157: 279-290.
 
Karpov, S. A., Bass, D., Mylnikov, A. P., & Cavalier-Smith, T. 2006. Molecular phylogeny of Cercomonadidae and kinetid patterns of Cercomonas and Eocercomonas gen. nov. (Cercomonadida, Cercozoa). Protist 157: 125-158.
 
Lara, E., Heger, T.J., Mitchell, E.A., Meisterfeld, R., and Ekelund, F. 2007. SSU rRNA reveals a sequential increase in shell complexity among the euglyphid testate amoebae (Rhizaria: Euglyphida). Protist 158: 229-237.
 

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